{"id":4910,"date":"2020-03-31T09:58:36","date_gmt":"2020-03-31T07:58:36","guid":{"rendered":"http:\/\/gdsreseau3m.com\/?p=4910"},"modified":"2020-03-31T10:27:42","modified_gmt":"2020-03-31T08:27:42","slug":"les-coronavirus-dans-le-monde-animal","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/gdsreseau3m.com\/?p=4910","title":{"rendered":"Les coronavirus dans le monde animal"},"content":{"rendered":"
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Les coronavirus dans le monde animal : u<\/span>ne grande diversit\u00e9 avec une clinique vari\u00e9e<\/span><\/h2>\n
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Les coronavirus \u2192<\/strong> Bien connu des \u00e9leveurs lors d\u2019\u00e9pisodes de diarrh\u00e9e n\u00e9o-natale ou de pathologie respiratoire, le nom de coronavirus vient de faire une entr\u00e9e fracassante aupr\u00e8s du grand public. La diversit\u00e9 des souches explique les diff\u00e9rentes formes cliniques.<\/em><\/p>\n<\/blockquote>\n

Les coronavirus appartiennent \u00e0 l\u2019immense famille\u00a0des Coronaviridae. <\/em>Cet article vous apporte quelques informations sur cette famille avec un focus sur les coronavirus chez les bovins connus depuis plus de 40 ans et le nouveau coronavirus humain, le covid-19. Rappelons ce qu\u2019indique l\u2019ANSES dans son avis du 09\/03\/2020\u00a0: \u00ab aucun virus appartenant au sous-groupe du SARS-CoV-2 n\u2019a \u00e9t\u00e9 d\u00e9tect\u00e9 chez les animaux domestiques (animaux de rente et de compagnie) et il n\u2019existe pas de lien g\u00e9n\u00e9tique direct entre le SARS-CoV-2 et les souches de Betacoronavirus isol\u00e9es chez les animaux domestiques \u00bb. <\/em><\/strong>[M\u00eame si cela est marginal, notez qu’un \u00e9l\u00e9ment est apparu depuis la parution de cet avis, <\/em>c’est la possible contamination des animaux de compagnie : un chat infect\u00e9 en Belgique ayant pr\u00e9sent\u00e9 des signes cliniques et deux chiens contamin\u00e9s \u00e0 Hong-Kong sans clinique].<\/em>
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C\u2019est quoi un virus\u00a0?<\/span><\/h3>\n

Les virus sont des entit\u00e9s pr\u00e9sentes en tr\u00e8s grande quantit\u00e9 sur terre (chiffre estim\u00e9 \u00e0 1031<\/sup>\u00a0!), que l\u2019on ne peut voir qu\u2019au microscope \u00e9lectronique et dont le statut \u00ab\u00a0d\u2019\u00eatre vivant\u00a0\u00bb fait encore d\u00e9bat. Ils s\u2019attaquent \u00e0 toutes les esp\u00e8ces, mammif\u00e8res (rage, fi\u00e8vre aphteuse, variole\u2026), plantes (mosa\u00efque du tabac, virus de la tomate\u2026) mais \u00e9galement bact\u00e9ries. Ce sont des agents infectieux dont la sp\u00e9cificit\u00e9 est l\u2019incapacit\u00e9 \u00e0 se reproduire seuls<\/strong>\u00a0; ils utilisent les cellules de leur h\u00f4te pour assurer leur multiplication, entrainant la destruction de la cellule responsable des l\u00e9sions observ\u00e9es. On les retrouve sous deux formes, inerte lorsqu\u2019ils sont en dehors d\u2019une cellule et active lorsqu\u2019ils se multiplient dans les cellules. Certains virus ont un patrimoine g\u00e9n\u00e9tique complet (ADN) mais d\u2019autres n\u2019ont qu\u2019un des deux brins (ARN).<\/p>\n

Le diagnostic des infections virales<\/span><\/h3>\n

La reproduction intracellulaire stricte des virus complique leur diagnostic et si la mise en culture sur des cellules reste possible, cela reste une technologie difficile \u00e0 mettre en \u0153uvre. L\u2019analyse la plus utilis\u00e9e aujourd\u2019hui est la PCR (Polymerase Chain Reaction) qui permet la mise en \u00e9vidence de l\u2019ADN ou de l\u2019ARN. C\u2019est une technique fiable, relativement rapide et avec un co\u00fbt maitris\u00e9. Il convient cependant de toujours confronter ce r\u00e9sultat \u00e0 la clinique, la seule pr\u00e9sence du virus n\u2019indiquant pas obligatoirement qu\u2019il est responsable de la pathologie observ\u00e9e.<\/p>\n

L\u2019autre technique de diagnostic est la s\u00e9rologie, avec mise en \u00e9vidence des anticorps fabriqu\u00e9s par l\u2019organisme en r\u00e9action \u00e0 l\u2019infection. Cela implique d\u2019identifier les anticorps \u00e0 rechercher et un certain d\u00e9lai est n\u00e9cessaire avant qu\u2019ils n\u2019apparaissent. L\u00e0 encore, un r\u00e9sultat positif est \u00e0 interpr\u00e9ter car il peut s\u2019agir d\u2019anticorps produits lors d\u2019une pathologie ant\u00e9rieure.<\/p>\n

Les coronavirus, une immense famille de virus<\/span><\/h3>\n

Les coronavirus forment\u00a0une immense famille de virus qui infectent toutes les esp\u00e8ces de mammif\u00e8res. Ils appartiennent \u00e0 la famille des Coronaviridae<\/em> et sont class\u00e9s en quatre groupes et de nombreux sous-groupes. Ce sont des virus \u00e0 ARN poss\u00e9dant un g\u00e9nome extr\u00eamement long (plusieurs milliers de\u00a0nucl\u00e9otides). Ils sont sp\u00e9cifiques de l\u2019esp\u00e8ce qu\u2019ils infectent, mais comme tous les virus \u00e0 ARN, ils sont plus sensibles aux mutations g\u00e9n\u00e9tiques avec les cons\u00e9quences induites\u00a0: passage sur d\u2019autres esp\u00e8ces, pouvoir pathog\u00e8ne qui peut \u00e9voluer, mise au point d\u2019un vaccin qui peut \u00eatre difficile. Le coronavirus est un virus envelopp\u00e9 donc fragile, sensible \u00e0 la chaleur (plus de 60\u00b0C), aux d\u00e9tergents et aux solvants.<\/p>\n

Le coronavirus chez les bovins, une atteinte digestive\u2026<\/span><\/h3>\n

D\u00e9couvert en 1972, le coronavirus bovin (BCoV) appartient au groupe des betacoronavirus. Toutes les souches sont actuellement regroup\u00e9es dans le m\u00eame s\u00e9rotype. Il est responsable principalement de gastro-ent\u00e9rites souvent s\u00e9v\u00e8res chez le veau non-immunis\u00e9, \u00e0 partir de 4-6 jours de vie. La transmission est oro-f\u00e9cale et respiratoire avec une incubation de 24h00 en moyenne. Le virus s\u2019attaque aux cellules de l\u2019intestin gr\u00eale et du c\u00f4lon, provoquant leur destruction et responsable d\u2019une diarrh\u00e9e avec fuite hydrique et baisse de la capacit\u00e9 d\u2019assimilation. Il n\u2019existe pas de m\u00e9dicament sp\u00e9cifique, le traitement fera appel \u00e0 la r\u00e9hydratation et aux pansements digestifs. Des vaccins contre ce virus existent depuis plus de 40 ans, la protection du veau se faisant par la prise de colostrum d\u2019une vache immunis\u00e9e. Plus de 70 % des bovins adultes sont porteurs sains du virus en faible quantit\u00e9, ce qui entretient leur immunit\u00e9. En cas de charge virale \u00e9lev\u00e9e ou de baisse des d\u00e9fenses immunitaires, de la dysenterie d\u2019hiver sur les vaches peut cependant \u00eatre observ\u00e9e.<\/p>\n

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\"\"Le coronavirus bovin peut \u00eatre responsable de diarrh\u00e9e chez le jeune veau. Transmis par les porteurs sains ou la persistance dans l\u2019environnement (pr\u00e8s de 6 mois sur certains supports), le virus impacte particuli\u00e8rement les veaux de 4 \u00e0 6 jours. La d\u00e9sinfection des b\u00e2timents et la vaccination des m\u00e8res sont les deux mesures \u00e0 mettre en place pour se pr\u00e9munir de cette pathologie. Une fois la maladie d\u00e9clar\u00e9e, l\u2019isolement rapide des veaux malades permet de limiter les contaminations ult\u00e9rieures, car m\u00eame cliniquement gu\u00e9ris, certains veaux restent excr\u00e9teurs pendant plusieurs semaines.<\/em><\/p>\n<\/div>\n

\u2026 et respiratoire<\/span><\/h3>\n

Dans les ann\u00e9es 80, l\u2019impact respiratoire du virus sur les jeunes animaux a \u00e9t\u00e9 mis en \u00e9vidence. Le tropisme digestif ou respiratoire du virus d\u00e9pend d\u2019une mutation de la prot\u00e9ine de la spicule (S) de l\u2019enveloppe, qui va conditionner la zone d\u2019attachement du virus dans l\u2019organisme. Cliniquement, les animaux vont pr\u00e9senter de la toux et du jetage, mais des complications de pneumonie peuvent survenir. Le diagnostic du coronavirus respiratoire se fait sur \u00e9couvillon nasal, voire pr\u00e9l\u00e8vement de poumon en cas de mort de l\u2019animal. Dans le cadre du kit respiratoire GDS Creuse, le virus est mis en \u00e9vidence sur 35 % des pr\u00e9l\u00e8vements PCR effectu\u00e9s en \u00e9levage, le plus souvent associ\u00e9 \u00e0 d\u2019autres agents pathog\u00e8nes, mais dans les ateliers d\u2019engraissement, plus de 80 % des taurillons sont porteurs du virus. Si l\u2019excr\u00e9tion digestive peut \u00eatre longue, l\u2019excr\u00e9tion nasale est de courte dur\u00e9e, ce qui limite la p\u00e9riode de contagiosit\u00e9.<\/p>\n<\/div>\n

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Un nouveau coronavirus humain, le covid-19<\/span><\/h3>\n

L\u2019homme peut h\u00e9berger classiquement quatre souches de coronavirus peu pathog\u00e8nes, du groupe des alphacoronavirus, responsables de rhume et de syndrome grippal l\u00e9ger.<\/strong><\/span><\/p>\n

Deux autres virus tr\u00e8s pathog\u00e8nes du groupe des betacoronavirus \u00e9taient apparus ces derni\u00e8res ann\u00e9es, le SRAS en Asie en 2002-2003, a priori \u00e9radiqu\u00e9, et le MERS en Arabie Saoudite en 2012 qui continue de circuler \u00e0 bas-bruit. Ils ont pour anc\u00eatres des virus isol\u00e9s chez diff\u00e9rentes esp\u00e8ces de chauves-souris qui ont vraisemblablement franchi la barri\u00e8re inter-esp\u00e8ces lors de mutations, en passant d\u2019abord par un mammif\u00e8re (civette dans le cas du SRAS, cam\u00e9lid\u00e9s dans le cas du MERS), puis \u00e0 l\u2019Homme.<\/span><\/p>\n

Apparu pour la premi\u00e8re fois en Chine en 2019, le SARS-CoV2 appartient au groupe des betacoronavirus et est responsable d\u2019une maladie respiratoire d\u00e9sign\u00e9e comme COVID-19 (CoronaVirus Disease \u2013 2019). L\u2019anc\u00eatre du virus est \u00e9galement la chauve-souris et les conditions du passage \u00e0 l\u2019homme sont encore incertaines. Les infections peuvent aller d\u2019une simple rhinite \u00e0 des formes respiratoires graves <\/strong>pouvant entrainer la mort par pneumonie dans un certain nombre de cas. La voie principale de transmission du virus est interhumaine<\/strong>, par contact entre les personnes ou \u00e0 travers l\u2019inhalation de gouttelettes infectieuses \u00e9mises par les patients lors d\u2019\u00e9ternuements ou de toux.<\/span><\/p>\n

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Une gestion sanitaire et m\u00e9dicale<\/span><\/h3>\n

L\u2019\u00e9pisode actuel de circulation du covid-19 sur les humains vient rappeler la n\u00e9cessit\u00e9 d\u2019une gestion sanitaire des risques infectieux. Cela passe par des mesures d\u2019isolement, de s\u00e9paration des esp\u00e8ces, de d\u00e9sinfection et \u00e9ventuellement de vaccination quand elle existe. En l\u2019absence de traitement sp\u00e9cifique de ces pathologies virales, seule l\u2019immunit\u00e9 permet de venir \u00e0 bout des virus. Le GDS se tient \u00e0 vos c\u00f4t\u00e9s pour passer cette p\u00e9riode difficile et reste \u00e0 votre disposition pour tout renseignement compl\u00e9mentaire.<\/p>\n

Dr Boris BOUBET – GDS Creuse<\/h6>\n
Le 25 mars 2020<\/h6>\n
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